Cloud9でMySQLの再インストールが必要になったとき、下記手順で可能。
ただしファイルの中身も消えてしまうので注意してください。

MySQL をアンインストールする

sudo yum remove mysql
sudo yum remove mysql-server
sudo yum remove mysql-libs

MySQLをインストールする

sudo yum --enablerepo=remi,epel,rpmforge install mysql-server